O Repositório Institucional da Universidade Federal Rural da Amazônia (RIUFRA) é um dispositivo de armazenamento e disseminação das obras intelectuais da UFRA, produzidas no âmbito das atividades de pesquisa, ensino e extensão da instituição. É composto de documentos em formato digital, provenientes das atividades desenvolvidas pelo corpo docente, discente e técnico-administrativo da UFRA e por obras elaboradas a partir de convênio ou colaboração entre a instituição e outros órgãos publicados em autoria e/ou coautoria.
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http://repositorio.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/1711
Title: | Caracterização genética da região promotora do gene do receptor de FSH em éguas da raça quarto de milha. |
Advisor: | SILVA FILHO, Ednaldo |
Authors: | SILVA, Roberta de Araújo |
Keywords: | Cavalo Quarto de Milha Equino Polimorfirmo Marcadores moleculares SNP Hormônio folículo estimulante Quarter mile horse Follicle stimulating hormone Equine Molecular markers |
Issue Date: | 2022-01-28 |
Publisher: | UFRA/Campus Belém |
Citation: | SILVA, Roberta de Araújo. Caracterização genética da região promotora do gene do receptor de FSH em éguas da raça quarto de milha. Orientador: Dr. Ednaldo da Silva Filho. 2022. 48 f. Dissertação (Mestrado em Reprodução Animal/Genética Animal) - Universidade Federal Rural da Amazônia, Belém, 2022. Disponível em: http://repositorio.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/1711. Acesso em: . |
Resumo: | O cavalo Quarto de Milha é uma raça que se destaca pela força, explosão e versatilidade, sendo usado em diversas modalidades esportivas equestres, onde se destacam a prova de tambor e vaquejada. A busca por animais geneticamente superiores e a possibilidade do uso de indivíduos com subfertilidade adquirida impulsionou o desenvolvimento de algumas técnicas reprodutivas em equinos. A partir da TE várias biotécnicas surgiram, rompendo a barreira da subfertilidade e infertilidade adquiridas. O hormônio folículo estimulante (FSH), uma glicoproteína secretada pela pituitária anterior, pode regular a função ovariana através do receptor FSH (FSHR), que regula o funcionamento do FSH, no qual desempenha um papel central na reprodução. Foram estabelecidas técnicas de biologia molecular como extração de DNA, PCR e sequenciamento de DNA, como também análises de bioinformática para identificar novos polimorfismos e futuras analises estatísticas associando os polimorfismos com as características reprodutivas em éguas com o objetivo de identificar polimorfismos genéticos na região promotora do gene do FSHR e associar tais polimorfismos com traços reprodutivos em éguas doadoras de embrião. Portanto, o objetivo com este trabalho foi caracterizar parte da região promotora e a região 5´não traduzida (5ÙTR) do gene do FSHR em equinos da raça quarto de milhas. Foi coletado sangue periférico de 81 éguas de três fazendas para extração de DNA, seguido da amplificação de 707 pb da região promotora do gene FSHR. Em seguida os produtos de PCR foram purificados e sequenciados pelo método de Sanger. As sequências foram alinhadas e comparadas entre as éguas. Analiticamente foram identificados três polimorfismos (SNPs), sendo dois na região promotora (-217G>T e -195G>A). No SNP-217, o alelo e o genótipo mais frequentes são G=0,939 e GG=0,902. No SNP -195, o alelo e o genótipo mais frequentes são G=0,896 e GG=0,841. Um SNP foi identificado na 5-ÙTR na posição 127A>G, sendo o alelo e o genótipo mais frequente G=0,729 e GG=0,602. O desequilíbrio de ligação foi significativo entre os SNPs -217 e -195. Foram identificados 74 segmentos com potenciais sítios de ligações na sequencia selvagem, sendo na posição -217 o Sp1 e TFAP-2alpha e na posição 195 o sitio para GR, enquanto que na sequência mutante foram identificados 71 segmentos, como os referidos sítios de ligações perdidos. A região reguladora do gene FSHR apresenta consideráveis variações polimórficas para análises populacionais que podem estar envolvios nos processos de seleção assistida por marcadores moleculares para características envolvidas em fatores reprodutivos. |
Abstract: | The Quarter Horse is a breed that stands out for strength, explosion and versatility, being used in various equestrian sports, where drum and vaquejada competitions stand out. The search for genetically superior animals and the possibility of using individuals with acquired subfertility boosted the development of some reproductive techniques in horses. From ET, several biotechnologies emerged, breaking the barrier of subfertility and acquired infertility. Follicle stimulating hormone (FSH), a glycoprotein secreted by the anterior pituitary, can regulate ovarian function through the FSH receptor (FSHR), which regulates the functioning of FSH, in which it plays a central role in reproduction. Molecular biology techniques such as DNA extraction, PCR and DNA sequencing were established, as well as bioinformatics analyzes to identify new polymorphisms and future statistical analyzes associating polymorphisms with reproductive traits in mares with the aim of identifying genetic polymorphisms in the promoter region of the FSHR gene and to associate such polymorphisms with reproductive traits in embryo donor mares. Therefore, the aim of this work was to characterize part of the promoter region and the 5'untranslated region (5ÙTR) of the FSHR gene in quarter horses. Peripheral blood was collected from 81 mares from three farms for DNA extraction, followed by amplification of 707 bp of the promoter region of the FSHR gene. Then the PCR products were purified and sequenced by the Sanger method. The sequences were line up and compared between mares. Allelic, genotypic frequencies and inbreeding coefficients were determined by the Analytically, three polymorphisms (SNPs) were identified, two in the promoter region (-217G>T and -195G>A). In SNP-217, the most frequent allele and genotype are G=0.939 and GG=0.902. In SNP -195, the most frequent allele and genotype are G=0.896 and GG=0.841. One SNP was identified in 5-ÙTR at position 127A>G, with the most frequent allele and genotype being G=0.729 and GG=0.602. Binding disequilibrium was significant between SNPs -217 and -195. 74 segments with potential binding sites were identified in the wild-type sequence, being at position -217 the Sp1 and TFAP-2 alpha and at position 195 the site for GR, which, while in the sequence, 71 segments were identified, as the missing binding sites. The regulatory region of the FSHR gene presents variations considered polymorphic for population selections that may be involved in the assistance processes for molecular markers for relevant traits in reproductive factors. |
URI: | http://repositorio.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/1711 |
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