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http://repositorio.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/1993
Título: | Associação do polimorfismo na 3’ UTR do gene IFN-γ com seu padrão de expressão gênica e do miRNA 125b no sangue de búfalas leiteiras com e sem hemoparasitoses. |
Orientador: | SILVA FILHO, Ednaldo da |
Autor(es): | SANTOS, Cintia Luana Pinheiro |
Palavras-chave: | Búfalas Melhoramento genético IFN-γ miRNA 125b Sistema imune Genetic improvement Immune system |
Data do documento: | 2023-06-23 |
Editor: | UFRA/Campus Belém |
Citação: | SANTOS, Cintia Luana Pinheiro. Associação do polimorfismo na 3’ UTR do gene IFN-γ com seu padrão de expressão gênica e do miRNA 125b no sangue de búfalas leiteiras com e sem hemoparasitoses. Orientador: Ednaldo da Silva Filho. 2022. 57 f. Dissertação (Mestrado em Saúde e Produção Animal na Amazônia/Saúde e Meio Ambiente) - Universidade Federal Rural da Amazônia, Belém, 2022. Disponível em: http://repositorio.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/1993. Acesso em: . |
Resumo: | O uso de marcadores genéticos bem como a determinação da expressão de genes envolvidos no sistema imune de búfalos é de extrema valia nos programas de seleção, pois podem promover a escolha de animais resistentes a muitos patógenos. O objetivo do estudo foi associar o Polimorfismo g4467 G>A no gene INF-γ com o seu perfil de expressão gênica bem como do miRNA 125b em búfalas leiteiras com hemoparasitoses. Foram coletadas amostras de sangue de 145 búfalas para extração de DNA através do método fenolclorofórmio, seguido das técnicas de PCR e RT-PCR para diagnóstico molecular dos agentes Babesia spp. Trypanosoma vivax e Anaplasma marginale, respectivamente. Todos os animais foram genotipados pela técnica do PCR-RFLP. Em seguida, o RNA total dos animais de diferentes genótipos foram extraídos para determinação das expressões do INF-γ e do miRNA 125b através da RT-PCR. Todas as búfalas foram negativas para Babesia spp. e A. marginale e apenas 12 foram positivas para o T. vivax. A PCR-RFLP revelou três padrões de bandas para o SNP estudado. Onde foram observados os genótipos GG, GA e AA, nas proporções 3,4%, 2,1% e 94,5% respectivamente e o alelo A o mais frequente (95,5%). O SNP apresentou desvio do Equilíbrio de Hardy-Weinberg (EHW) (P<0,05) e déficit de heterozigotos com FIS 0,759. Todos os animais dos genótipos encontrados apresentaram expressão para ambos os genes, exceto o GG positivo o qual, não foi detectado. O perfil de expressão do INF-γ foi maior nos genótipos GA e GG negativos e AA positivo. Contudo, o perfil de expressão do miRNA 125b foi menor para os genótipos AA e GA positivos e maior para os três genótipos negativos. Dessa forma, os resultados sugerem que o SNP avaliado na população apresentou baixa variabilidade por se tratar de um rebanho leiteiro que provavelmente se encontra sob pressão de seleção e que as búfalas AA positivas mesmo que assintomáticas para T. vivax podem mostrar-se susceptíveis a infecção devido a maior expressão do INF-γ e menor do miRNA 125b. Entretanto, as búfalas GG e GA negativas por terem exibido maiores níveis de expressão para ambos os genes podem ser consideradas geneticamente resistentes à infecção por T. vivax. |
Abstract: | The use of genetic markers as well as the determination of the expression of genes involved in the immune system of buffaloes is of extreme value in selection programs, as they can promote the choice of animals resistant to many pathogens. The aim of the study was to associate the polymorphism g4467 G>A in the INF-γ gene with its gene expression profile as well as miRNA 125b in dairy buffaloes with hemoparasitoses. Blood samples were collected from 145 buffaloes for DNA extraction using the phenolchloroform method, followed by PCR and RT-PCR techniques for molecular diagnosis of Babesia spp. Trypanosoma vivax and Anaplasma marginale, respectively. All animals were genotyped using the PCR-RFLP technique. Then, the total RNA of the animals of different genotypes was extracted to determine the expressions of INF-γ and miRNA 125b through RT-PCR. All buffaloes were negative for Babesia spp. and A. marginale and only 12 were positive for T. vivax. PCRRFLP revealed three band patterns for the studied SNP. Where the GG, GA and AA genotypes were observed, in the proportions 3.4%, 2.1% and 94.5% respectively and the most frequent A allele (95.5%). The SNP showed deviation from the Hardy-Weinberg Equilibrium (EHW) (P<0.05) and deficit of heterozygotes with FIS 0.759. All animals of the genotypes found showed expression for both genes, except for the positive GG, which was not detected. The INF-γ expression profile was higher in GA and GG negative and AA positive genotypes. However, the miRNA 125b expression profile was lower for the positive AA and GA genotypes and higher for the three negative genotypes. Thus, the results suggest that the SNP evaluated in the population showed low variability because it is a dairy herd that is probably under selection pressure and that AA-positive buffaloes, even if asymptomatic for T. vivax, may be susceptible to infection due to higher expression of INF-γ and lower expression of miRNA 125b. However, buffaloes GG and GA negative for having higher levels of expression for both genes can be considered genetically resistant to infection by T. vivax. |
URI: | http://repositorio.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/1993 |
Aparece nas coleções: | Dissertações - Saúde e Produção Animal na Amazônia (Belém) |
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