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O Repositório Institucional da Universidade Federal Rural da Amazônia (RIUFRA) é um dispositivo de armazenamento e disseminação das obras intelectuais da UFRA, produzidas no âmbito das atividades de pesquisa, ensino e extensão da instituição. É composto de documentos em formato digital, provenientes das atividades desenvolvidas pelo corpo docente, discente e técnico-administrativo da UFRA e por obras elaboradas a partir de convênio ou colaboração entre a instituição e outros órgãos publicados em autoria e/ou coautoria.


  1. Repositório Institucional da Universidade Federal Rural da Amazônia - RIUFRA
  2. BDTD
  3. PPGIZT - (antigo PPGPAA Parauapebas)
  4. Dissertações - Zootecnia nos Trópicos - Parauapebas (antigo PPGPAA/Parauapebas)
Use este identificador para citar ou linkar para este item: https://repositorio.ufra.edu.br/jspui/handle/riufra/2747
Título: Estudo de polimorfismos nos genes CSN1S1 e CSN3 em fêmeas bubalinas de padrão racial Murrah.
Orientador: RODRIGUES, Marília Danyelle Nunes
Autor(es): MEDEIROS, Natalia Bianca Caires
Palavras-chave: Búfala - Raça Murrah
Leite
Caseína CSN2S1
Caseína CSN2
Caseína CSN3
Variante genética
Sequenciamento
SNP
Raça Murrah
Milk
Buffalo
Genetic variants
Sequencing
Data do documento: 2025-09-01
Editor: UFRA - Campus Parauapebas
Citação: MEDEIROS, Natalia Bianca Caires. Estudo de polimorfismos nos genes CSN1S1 e CSN3 em fêmeas bubalinas de padrão racial Murrah. Orientadora: Dra. Marília Danyelle Nunes Rodrigues. 2020. 48 f. Dissertação (Mestrado em Saúde e Produção Animal na Amazônia/Tecnologia na Produção Animal) - Universidade Federal Rural da Amazônia, Belém, 2020. Disponível em: https://repositorio.ufra.edu.br/jspui/handle/riufra/2747. Acesso em: .
Resumo: As características do leite, são controladas por vários genes, com destaque para os quatro genes da caseína, CSN1S1; CSN1S2; CSN2 e CSN3, que são responsáveis por codificar as quatro frações da referida proteína, são elas, a α-caseína que inclui α (S1) e α (S2), β e κ-caseína. O estudo de variantes genéticas nesses genes, buscam investigar alelos, inserções ou deleções, que possam refletir diretamente em características produtivas, indicando diferenças na qualidade, composição e rendimento do leite. Dessa forma, o objetivo desse estudo é investigar a ocorrência de polimorfismos nos genes CSN1S1 e CSN3, em fêmeas bubalinas de padrão racial Murrah. Os genes CSN1S1 e CSN3, foram analisados em 41 búfalas da raça Murrah em lactação, por meio do sequenciamento de nucleotídeos. Os pares de primers amplificaram fragmentos de 313 pares de base (pb) para o gene CSN1S1, e 350 pb para o gene CSN3. Um SNP foi encontrado no fragmento amplificado para o gene CSN1S1, localizado no nucleotídeo de número 2.123 da região promotora (5' UTR), na posição nt-258 (A/G), o qual não causa nenhuma alteração de aminoácido. As frequências genotípicas observadas desse SNP foram distintas das frequências genotípicas esperadas (EHW - Equilíbrio de Hardy -Weinberg), e além disso, a heterosigosidade observada (Ho) apresentou-se maior que a heterosigosidade esperada (He). Quanto ao gene CSN3, foram identificados nesse estudo, dois SNPs nt-98 e nt-102 (nucleotídeos de número 377 e 381 do éxon de número 4, do gene CSN3), presentes nos códons 33 (A C C / A T C) e 34 (AC C / AC T) do fragmento analisado, os quais correspondem aos códons 135 e 136 do peptídeo maduro, e que, uma vez traduzidos, resultam nos aminoácidos Treonina (Thr) / Isoleucina (Ile), no caso dos códons ATC / ACT e Treonina / Treonina, para os códons ACC / ACC. De acordo com as análises, as frequências genotípicas e observadas foram distintas para o gene CSN3. E mais uma vez, a heterosigosidade observada (Ho) apresentou-se maior que a heterosigosidade esperada (He), sugerindo-se assim, um excesso de heterozigotos em relação ao modelo de equilíbrio de Hardy-Weinberg. Um novo SNP foi encontrado no gene CSN1S1 (5' UTR) em búfalos, e outros 2 polimorfismos no gene CSN3 (éxon 4) ainda não descritos em bubalinos do padrão racial Murrah, criados sob clima tropical, foram investigados. Com isso, o conhecimento de polimorfismos de genes candidatos em búfalos leiteiros sugere e fomenta que sejam realizados estudos que objetivem estabelecer associações entre tais variantes e características de produção de leite e seus derivados, viabilizando a seleção assistida por marcadores moleculares.
Abstract: The characteristics of milk are controlled by several genes, with emphasis on the four casein genes, CSN1S1; CSN1S2; CSN2 and CSN3, which are responsible for encoding the four fractions of that protein, are they, α-casein which includes α (S1) and α (S2), β and κ-casein. The study of genetic variants in these genes, seek to investigate alleles, insertions or deletions, which may reflect directly on productive characteristics, indicating differences in the quality, composition and yield of milk. Thus, the objective of this study is to investigate the occurrence of polymorphisms in the CSN1S1 and CSN3 genes, in buffalo females of the Mur-rah racial pat tern. The CSN1S1 and CSN3 genes were analyzed in 41 lactating Murrah buffaloes, using nucleotide sequencing. The primer pairs amplified fragments of 313 base pairs (bp) for the CSN1S1 gene, and 350 bp for the CSN3 gene. An SNP was found in the amplified fragment for the CSN1S1 gene, located in nucleotide number 2.123 of the promoter region (5 'UTR), at position nt-258 (A / G), which does not cause any amino acid alteration. The observed genotypic frequencies of this SNP were different from the expected genotypic frequencies (EHW - Hardy-Weinberg Equilibrium), and in addition, the observed heterosigosity (Ho) was higher than the expected heterosigosity (He). As for the CSN3 gene, two SNPs nt-98 and nt-102 (nucleotides number 377 and 381 of exon number 4, of the CSN3 gene) were identified in codons 33 (ACC / ATC) and 34 (AC C / AC T) of the analyzed fragment, which correspond to codons 135 and 136 of the mature peptide, and which, once translated, result in the amino acids Threonine (Thr) / Isoleucine (Ile), in the case of the ATC / ACT codons and Threonine / Threonine, for the ACC / ACC ha-plotypes. According to the analyzes, the genotypic and observed frequencies were different for the CSN3 gene. And again, the observed heterosigosity (Ho) was greater than the expected heterosigosity (He), thus suggesting an excess of hetero-zygotes in relation to the Hardy-Weinberg equilibrium model. A new SNP was found in the CSN1S1 gene (5 'UTR) in buffaloes, and another 2 polymorphisms in the CSN3 gene (exon 4) not yet described in buffalo of the Murrah racial pattern, raised under tropical climate, were investigated. Thus, the knowledge of candidate gene polymorphisms in dairy buffalo suggests and encourages studies to be carried out that aim to establish associations between such variants and characteristics of milk production and its derivatives, enabling selection assisted by molecular markers.
URI: https://repositorio.ufra.edu.br/jspui/handle/riufra/2747
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